姬邦卉接连获胜，兵进至东台山（今河北张家口市涿鹿县小五台山一带），与蚩尤军主力相遇。双方大战，轩辕军战败。姬邦卉只好率队伍北撤。蚩尤急于收复失地，命共工和夸父部追击轩辕军，一直追到玉邦河以北。姬邦卉大怒，组织军队反击，在玉泉（今山西大同市天镇县）击败了共工和夸父族。共工、夸父族兵败后逃往涿鹿，中途又遭到八任炎帝姜榆罔的截杀，再次兵败。幸好此时蚩尤军赶来救援，才没有遭到更大的伤亡。
邦卉三十二年（乙未，前4526），中国远古史上第一次大规模的野蛮战争在涿鹿山下的旷野展开。一方是少典轩辕氏和炎帝神农氏的联盟军队，另一方是九黎蚩尤氏和东夷少昊氏、魁隗氏后裔共工和夸父族的联盟军队。姬邦卉多次向蚩尤军发起攻击，结果都被击败。这场战争足足打了三年，双方都受到了重大的损失。姬邦卉知道，再打下去也很难有取胜的把握，便主动与蚩尤军议和，双方休战。
姬邦卉深知自己指挥作战的能力远不如蚩尤，停战后他只身前往博望山（今安徽马鞍山市当涂县西南）拜师学习兵法，苦学三年，掌握了许多攻战和防守的策略。他下山回国后，又花费了三年时间对军队进行实战训练，最后觉得有必胜的把握之后，才再次发动涿鹿大战。
邦卉四十二年（乙巳，前4516），轩辕军再次联合炎帝神农氏，攻打蚩尤军。命应龙率众在上游拦河筑坝，积蓄河水，然后水淹蚩尤城。蚩尤军大败。
邦卉四十三年（丙午，前4515），轩辕军与蚩尤军继续大战。姬邦卉听从谋臣玄女之谋，使武士潜入蚩尤氏祖灵祭地灵山，进入虁牛龙池，杀死了蚩尤族供奉崇拜的灵虁，并且将虁牛剥皮，制成军鼓，于军中敲击，惑乱蚩尤军心。轩辕军乘蚩尤军士气低落之机，再次发动猛烈地攻击，蚩尤军大败。蚩尤率残部渡滏阳河，前往中冀栾台中心（今河北冀州市）。轩辕军随后追到，将帝蚩尤等数十人包围在解村。蚩尤率众浴血奋战，身负重伤，终因寡不敌众，被轩辕军活捉。姬邦卉命部下将他押往黎山之丘处死，以绝后患。
邦卉四十四年（丁未，前4514），轩辕军继续追杀蚩尤族人，又杀死了蚩尤的柱下史（史官）刑天，继而挥师南进，攻打东夷少昊族和魁隗氏后裔共工、夸父部族，于冬十月击败夸父族，杀死了魁隗氏九世孙夸父。接着又全力攻打东夷少昊部，少昊族大酋长主动投降，并且领兵西征，讨伐蚩尤的同党风伯。风伯不敌，兵败后被少昊部活捉。
至此，中原黄河流域大部分地区归轩辕氏所有。
姬邦卉野心勃勃，正欲驱兵进攻炎帝神农氏部族，不料突染疾病，救治无效而死。
姬邦卉二十二岁继任轩辕氏大酋长，在位执政虚记四十五年（王大有《三皇五帝时代》），卒于邦卉四十四年（丁未，前4514），终年六十六岁。死后遗体葬在封丘（今河南新乡市封丘县东）。
姬邦卉在位年表
前4557（甲子）元年
前4556（乙丑）二年
前4555（丙寅）三年
前4554（丁卯）四年
前4553（戊辰）五年
前4552（己巳）六年
前4551（庚午）七年
前4550（辛未）八年
前4549（壬申）九年
前4548（癸酉）十年
前4547（甲戌）十一年
前4546（乙亥）十二年
前4545（丙子）十三年
前4544（丁丑）十四年
前4543（戊寅）十五年
前4542（己卯）十六年
前4541（庚辰）十七年
前4540（辛巳）十八年
前4539（壬午）十九年
前4538（癸未）二十年
前4537（甲申）二十一年
前4536（乙酉）二十二年
前4535（丙戌）二十三年
前4534（丁亥）二十四年
前4533（戊子）二十五年
前4532（己丑）二十六年
前4531（庚寅）二十七年
前4530（辛卯）二十八年
前4529（壬辰）二十九年
前4528（癸巳）三十年
前4527（甲午）三十一年
前4526（乙未）三十二年
前4525（丙申）三十三年
前4524（丁酉）三十四年
前4523（戊戌）三十五年
前4522（己亥）三十六年
前4521（庚子）三十七年
前4520（辛丑）三十八年
前4519（壬寅）三十九年
前4518（癸卯）四十年
前4517（甲辰）四十一年
前4516（乙巳）四十二年
前4515（丙午）四十三年
前4514（丁未）四十四年
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