公元1649年5月12日，朱慈烺和周仁远率领文武群臣祭拜过天地。在金陵码头，周仁远摊开《北伐檄文》对着群臣和众将领和士兵宣读道“昔五胡乱夏，仅一再传而灭。今东虏应谶，适二八秋之期。诚哉天道好还，况也人心思汉。慨自李贼倡叛，神京陆沉。建酋本我属夷，屡生反侧，遂乘多难，窃踞中原。衣冠变为犬羊，江山沦于戎狄。凡有血气，未有不痛心切齿于奴酋者也。本藩奉天倡义，代罪吊民，卧薪尝胆，法古用兵。生聚教训，已逾十年。正朔难偏，南方一统。兹者亲统大师，首取京师，出生民于水火，复汉官之威仪。尔伪署文武将吏，皆系大明赤子，谁非龙国绅衿。时穷势屈，委质虏廷，察其本怀，宁无隐忍？天经地义，华夷之辨甚明；木本水源，忠孝之良自在。至如辽人，受我朝三百年之豢养，遭逆虏三十载之摧残。祖父既受其刑毒，母妻甚被其宣淫。尔二三孤儿，尚为旗下之奴；百千弱女，竟作胡中之妇。报仇雪耻，岂待异时；归正反邪，端在今日。则张良报韩，先挥博浪之椎；朱序归晋，遂成淮淝之捷。或先机革面，或临敌改图。以全省全部来归者，不吝分茅裂土；以一邑一镇来归者，定与度地纪勋。或率兵而至，则论其众寡而照数授职；或洁身而来，则就其职掌而量材超擢。若蒙古、女真，世受国家抚赏之恩，原非一类，共在天地覆载之内，亦有同仇，无怀二心，视之一体。不但休屠归汉，名高日；且如回纥扶唐，烈光叶护矣。本藩仁义素着，赏罚久明。先机者有不次之赏，后至者有不测之诛。一身祸福，介在毫芒；千古勋名，争之顷刻。师不再举，时不再来，布告遐迩，咸使闻知。敬哉特谕！”
读完檄文，周仁远一挥手道“大军出发！”便登上了战船。只见长江码头密密麻麻的大小战船遮天蔽日地向北驶去，战船的士兵高呼着“北伐！北伐！”
前来送行的朱慈烺和孙承宗等人双眼含泪，也振臂高呼道“北伐！北伐！”而金陵城内的百姓在街上也齐声高呼着“北伐！北伐！”南方各省到处沸腾着，大明总算开始北伐了！
山东登州残存的满清二三十艘水师战船正在海上巡逻，指挥舰上的哨兵突然惊叫道“明军的水师打过来了！”
指挥舰上的水师总兵定睛一看，海上出现了数百艘明军战船正向他们驶来。总兵吓的屁滚尿流，我的妈啊！这么多巨大的战船！他当即下令道“快，快进港登陆，逃命要紧！”
清军水师战船急忙掉头，朝着登州港急忙拼命驶去。郑成功命令水师追上前去，对着清军水师一阵猛轰，须臾之间，清军登州水师灰飞烟灭。
郑成功没有下令急着登陆，而是下令水师把登州城围了个水泄不通，不断用火炮轰击登州城。
坐镇济南的济尔哈朗得到急报后大惊失色，他把大量的军队部署在长江北岸的兖州府一带，没想到大明的军队竟然从海上直接攻打登州府。这下麻烦了，他立即下令吴三桂从兖州率兵前往登州府抵挡明军的进攻。
而就在郑成功攻打登州的时候，湘军的水师继续北上，直取天津卫。他们航行了数日，进入了渤海湾。周仁远对黄爵说道“我们进入了鞑子的腹地，鞑子肯定要拼命救援京师，你和你的官兵一定要奋力死战，为延平郡王和候总督他们争取时间。”
“是，殿下！末将当一定率兵与鞑子死战到底！”黄爵凛然道。
天津卫驻扎着三千满清士兵，看到大批的明军水师登陆，吓的龟缩在城里，急忙向京师求援。
京城里，顺治和满汉群臣人心惶惶，明军水师攻打山东已经把他们吓的够呛了。这时兵部又来急报“报，明军攻打天津卫，天津危急，请求支援！”
“什么？明军在攻打登州的同时，竟然还在攻打天津卫？”顺治和满汉大臣吸了口凉气。
“报……朝云三万士兵十日前已经渡过鸭绿江，正在攻打辽东！”又有兵部急报陈了上来。
“报……陕西明军攻打潼关，与我军相持不下！豫亲王多铎请求增援！”
“报……河南明军攻下开封，正向山西进军！”
“轰”的一声，满朝文武炸开了锅，也顾不得朝堂礼仪都纷纷大声惊慌失措地谈论起来。顺治帝“哇”的一声哭了起来，嘴里叫道“这可怎么办？这可怎么办？”
索尼高声叫道“快，快把太后请来！”
不一会儿，庄妃在王德化的牵引下来到了乾清宫，看着满朝乱糟糟的情况高声说道“怎么回事？都给哀家镇定些，到底出了何事？”然后训斥顺治道“皇上，你乃一国之君，当有泰山崩于前而面不改色的气度，你看看你，哭哭啼啼的成何体统？”
众人被庄妃这么一说，都安静下来。顺治羞愧道“母后，朕方寸已乱，还请母后主持大局！”
庄妃坐下后，问道“到底出了什么大事啊？难道是明军打过来了？”
“回禀太后，正是明军打过来了！”索尼禀报道，然后把目前的局势向庄妃叙述了一遍。
庄妃听完双眉紧锁，双手不停地揪着手帕道“诸位大臣，你们先说说吧，该怎么处置？捡重点的说，哀家不希望听到废话。”
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