“那要想办法离开这里。”小智随后说到。
这个时候门口出现了皮卡丘的声音，皮卡丘提示小新几人和乔伊小姐走通风口，随后小新几人和乔伊小姐爬出了通风口，乔伊小姐马上去打开精灵医院紧急的电源。
精灵医院的门口火箭队三人组遇到了可疑人员。可疑人员头领问到。
“你们几个，来这里做什么。”
“我们可是芳缘地区到头把交椅，火箭队，你们想要找我们打架。”火箭队三人组说着。
随后火箭队开始放出精灵和可疑人员的精灵对战在一起，随后火箭队三人组被打败了。击败了火箭队三人组，可疑人员带着梅滋教授快步朝着古辰遗迹行动。小新几人等精灵医院通了电，随后交代了乔伊小姐报警，小新几人出发去古辰遗迹，想要救出梅滋教授。
可疑人员带着梅滋教授来到了遗迹，随后叫梅滋教授打开，梅滋教授和可疑人员解释了一下，打开遗迹需要4个钥匙，随后可疑人员拿出来4个钥匙。可疑人员知道只有梅滋教授才可以打开遗迹，梅滋教授拒接了，可疑人员用精灵医院的人和精灵威胁了梅滋教授。
梅滋教授只好接受了可疑人员的提议，随后梅滋教授打开了遗迹。随后可疑人员跑进来遗迹，梅滋教授跟了进去，看到了古代人的壁画。可疑人员在遗迹里面搜寻了一番，没有找到该找的东西，拷贝了遗迹里面的资料，做着飞机逃走了，小新几人刚好赶到，看见可疑人员跑了。
随后小新几人来到了遗迹，见到了安全的梅滋教授，随后遗迹出现了反应，机关开始启动，遗迹出现了一个地洞。梅滋教授带着小新几人朝着地洞走去。梅滋教授和小新几人来到地下，看到了一片地下湖。地下湖出现了古代精灵古空棘鱼，小新看着古空棘鱼想要收服，随后询问了梅滋教授，小新派出了喷火龙，击败了一群古空棘鱼，随后丢出了精灵球抓捕了古空棘鱼。多余的古空棘鱼传送到了生态园。
小新几人和梅滋教授返回了精灵医院，遇到了很多警察和君沙小姐，随后几人把知道情况告诉了君沙小姐，随后小新把身上的5只古空棘鱼传送到了生态园。随后小新几人去休息了，梅滋教授也去休息了。
第二天，小瑶拿到了火稚鸡，火稚鸡恢复了，随后小新几人想要去挑战道馆了。随后小新几人和梅滋教授告别了，开始朝着第一个道馆开始前进了。
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