英军舰队这边经过几场战斗之后，战舰损失不少，如今只剩下不足三十艘战舰，但对比起太平军海军来说，还是一块非常难啃的硬骨头。通宝和尚的本意是想借助他对这一代海域的熟悉，加上大雾的掩护，率领舰队上来给英军舰队一个措手不及的打击，但事与愿违，大雾在太阳出来之后逐渐消失，而英军舰队外围的警戒船散布的很远，因此他们被发现了。
看到这个情况，通宝和尚知道现在的情况已经不是偷袭了，而是要面对英国舰队的直接决战，这与当时定下的海上游击策略严重不符，可现在他所统率的舰队里，很多船只是没有蒸汽动力的，依靠风帆操作的话，有一部分船只可能会被敌人舰队追上，当下要么壮士断腕，留下一部分船只阻击敌人，让舰队得以脱离战斗，要么全部舰队压上死拼，提前和敌人决战！
通宝和尚没有犹豫多久，他命令旗舰升起代表决一死战的红色海马旗，这是东海舰队特有的传统，因为东海舰队中很大一部分船员原来就是活跃在这一片海域的海马帮。
战斗命令下达之后，靖远号、威远号两艘姊妹舰马上开始调整战斗位置，九艘快速帆船迅速占据上风位置，其余七十余艘红单船、福船、沙船也各自做好了准备。
英军舰队外围五艘警戒船最先遭到了太平军舰队的炮击，这几艘战舰速度虽快但火力和吨位明显不是靖远号和威远号的对手，加上太平军舰队中同样速度很快的九艘快速帆船的包抄，这五艘英军舰船很快败下阵来，它们一边娴熟的躲避还击，一边迅速朝英国舰队本阵靠拢。
追逃的过程中，两艘英军战舰的风帆桅杆被击毁，失去动力的战舰速度很快降了下来，蜂拥而来的太平军战舰很不客气的迅速将两艘船击沉，令船上的舰长考虑升起白旗投降的时间都没有。
另外三艘英军战舰也都带伤逃回本阵，随护何伯看清了对方舰队的实力，除了靖远号和威远号这两艘原本是法国2700吨的一级战舰有些扎手之外，其余的太平军战舰似乎都不值一提，一艘红单船最多数百吨的吨位，船上只有可怜十多门火炮，还不如一艘较大的英军武装商船厉害。但何伯似乎忘记了一件事，那就是数量达到一定程度的时候是可以改变质量的。
舟山海战开始了，英军舰队先集中几艘主力战舰和靖远号、威远号进行炮战，双方的火炮都同样的致命，但靖远号和威远号有一点稍微可以弥补的优势，这两艘战舰在去年接受了改造，太平军在上海造船厂给两艘战舰在水线以上位置覆盖了一层十厘米厚的装甲，这大大加强了它们的防护能力，但唯一的弱点还是在于船身两侧开放的舷窗炮位，一旦炮弹命中这些地方，破坏力惊人的轰击弹还是会在船身上开一大个口子。
靖远号和威远号抵挡住了包括何伯旗舰在内八艘主力战舰的围攻，占据上风位置扯起风帆加上蒸汽动力驱动的两艘战舰速度较快，能灵活躲避敌人的炮击，同时船身上的装甲保证了它们的防护能力，所以才能勉强抵挡一阵，但好汉架不住敌人舰队的炮多，英军炮手操作非常熟练，他们操作火炮发射的时间间隔很短，而太平军的炮手则比不上他们，所以承受的炮火也较多。
另一边九艘快速帆船和70多艘红单船、福船和大沙船与二十多艘英舰站在一处，几乎一个照面就有十艘福船或大沙船被击沉，而他们只向敌人发射了一轮炮弹。好在他们数量众多，英国舰船就算要拍蚊子也得一个个的来，而红单船、福船和沙船的生存能力虽然够呛，但它们装备的火炮却足够致命，哪怕何伯的旗舰被红单船上的轰击炮打中一炮，木质船身也会受到损坏的。
随着时间的推移，英舰逐渐占据了优势，他们损失了五艘战舰，但却把三十多艘太平军战舰送到了水底，虽然靖远号和威远号还在苦苦支撑，但风帆桅杆被击毁之后，船速更加减慢了下来，通宝和尚看到这个情景，知道除非出现奇迹，否则他的舰队最多再打沉敌人几艘战舰之后就会全军覆没了。
就在这个时候，一名瞭望手兴奋的喊道：“看，南边，那是是南海舰队的旗号……”
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