第二天的早朝，朱由检破天荒地去晚了。其实这也怪不得他，京师戒严一个月，他也在天坛祈年殿呆了一个月，更兼昼夜督战，连个澡都没洗过，早累得筋疲力尽。见过卢象升后，他先去看望了仍在静养的令妃戚美凤，然后又到坤宁宫，才第一次见到自己的儿子、小皇子朱慈照。
抱着粉嫩嘟嘟、正在呼呼大睡的小家伙，朱由检不禁感慨万分。为了保护千千万万这样的孩子，大明从官军到百姓已经牺牲了不下百万人，然而满清仍在肆虐，自己这个皇帝任重道远。
皇后蕊儿则生怕朱由检累着，体贴地让宫女把孩子抱走。朱由检狼吞虎咽吃罢晚饭，痛痛快快洗了个澡，往床上一躺，连五秒钟都没到就睡死过去。第二天若不是蕊儿叫他，朱由检还没准睡到什么时辰呢。
朱由检醒来才意识到，自己来坤宁宫，本应好好抚慰蕊儿一番，结果光顾着睡大觉，不免冷落了佳人，只得不好意思地笑道：“唉，你看我这…要不晚点再上朝？”
蕊儿却满脸娇羞地道：“万岁勿要取笑，还应以国事为重。”
“那我今晚再来吧！”
“那怎么行。”蕊儿温存地道，“按照后宫的规矩，万岁今晚该去玉怜姐姐那，蕊儿有慈照做伴就好了。”
“这段时间后宫千斤重担全压在你身上，还要帮美凤带孩子，真是辛苦了！”朱由检动情地道，“你放心，朕今后卖卖力气，一定要让你怀上！”
说着他就凑上去亲吻蕊儿，正巧这时伊伊进来伺候，登时臊了个大红脸。蕊儿也赶紧推开朱由检，含羞嗔道：“万岁还不快去上朝，大臣们都快等急了！”
朱由检这才恋恋不舍地出了坤宁宫，不时回味着蕊儿那艳赛桃花的美貌和温润诱人的娇躯，又想起还未满月的儿子，更加下定决心：哪怕只是为了她们，也一定要当好这个皇帝，决不让历史的悲剧重演！
不过一进乾清宫，气氛就为之一变。在京师被围这段时间，朱由检驻陛天坛，更多的时候则是在城上，一次朝也没上过。除了每天见见阁臣之外，其他大臣他一律不见。至于多如牛毛的奏折，只要不是与战局有关的，绝大部分都被他留中，因为事有轻重缓急，他必须把全部精力都投入到抗击满清中去。
现在满清退兵了，这些积压的奏折有些就不得不处理了。而且很多人也是憋了一肚子话要对皇帝说，朱由检身为皇帝，也就不得不面对这个国家所有棘手的、别人无法解决的问题，谁让他是大明帝国的最高统治者、最终负责人呢。
果不其然，刚刚见礼完毕，朱由检还没来得及说话，便有户科给事中韩一良参劾首辅韩爌，说他在戒严期间装病，不出府理事，尸位素餐，实属可恶，应立即罢黜。
朱由检只得向群臣解释，韩爌是奉旨装死以麻痹清军。虽然没起到多大作用，但不出府门确实是自己的旨意，不干韩爌的事。
紧接着又有陕西道御史高赉明参奏兵部尚书袁可立，指责兵部对此次满清入寇负有不可推卸的责任，袁可立做为兵部尚书难辞其咎，必须交部严处。
朱由检听着已经不大舒服，因为只有他才清楚，皇太极是一定要率兵入关的，只是时间早晚的问题罢了。别说是袁可立，就是换了玉皇大帝来，鞑子照样会南侵。而朝廷兵力、粮饷捉襟见肘，兵部本来就是巧妇难为无米之炊，再说很多军事部署都是自己直接决定的，现在追究责任打袁可立的板子，这无论如何也说不过去。况且在朱由检看来，此次明军破坏了清军的战略意图，应该算是取得了战役的胜利，根本就没有处置袁可立的理由。
但是高赉明所言，乍听起来又不无道理。他说的数十府县被攻破焚毁，百姓流离失所等事也都是事实，对整个国家来说，这确实是一次非常严重的被入侵事件。很多大臣也根本不理解朝廷的军事部署，纷纷附和高赉明，指责兵部逡巡避战。
袁可立也是个性格刚强的人，本来自己衣不解带守了半个多月的城，力保京师无恙；这些御史言官打仗的时候在城里缩着什么事也不干，现在仗打完了，居然第一件事就是来参劾自己，登时大怒，怒气冲冲地奏道：“既然臣被说得如此不堪，请陛下重加惩处！”
朱由检只得劝解道：“袁尚书所请不允。尚书大人亲冒矢石守城半月，就算没功劳也有苦劳。满清兵锋甚锐，换谁也未必能挡住。此时互相指责、追究责任并非急务，研究下一步如何破敌才是正题，高御史所奏亦不允。”
按说朱由检已经比较明确地表了态，这些御史言官也该有所收敛了。阁臣中的李标、钱龙锡等人，便用眼神向言官中的东林党人示意，让他们不要再在这个话题上纠缠下去，以免触怒皇帝。
可是一方面朝臣中并非都是东林党，另一方面，东林党也并非真正意义上的党派，而只是个松散的政治联盟，里面鱼龙混杂，什么人都有。因此即使是东林党人，如有不同政见，也不会在乎钱龙锡这样的领袖，自己想说什么便说什么，像韩爌、钱龙锡这样位高权重的东林大臣，也对他们无可奈何。
因此言官们根本不在乎阁臣的暗示，仍然不停地出班参劾。朱由检耐着性子应付了两个，心想再这么下去就别干正事了，于是立即打断他们，宣布打算让卢象升取代洪承畴出任三边总督，继续清剿流贼，让大臣们发表意见。
本来朱由检觉得卢象升在京师保卫战中战功赫赫，这个任命应该不会有太大异议。没想到话音刚落，就有一名言官高声叫道：“陛下，万万不可！卢象升劣迹斑斑，正该锁拿进京，交部严处，怎能继续升迁？”
朱由检见发言者是工科给事中王都，便皱眉问道：“卢象升有何劣迹？”
王都把脖子一梗，振振有词地道：“现有前朝阁臣郭之琮的举发信在此，告卢象升临阵脱逃，致使涿鹿镇失陷！”
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