面对大臣的劝阻，朱由检把“殉葬”搬出来说事，立刻堵上了群臣的嘴巴。
原来明太祖朱元璋开了一个非常恶劣的先例，就是皇帝死后，后宫要有人殉葬，他本人即有三十多名嫔妃殉葬。殉葬制度本来自汉代就已废止，这不能不说是朱元璋开的一个大大的历史倒车。
朱元璋之后，除了建文帝生死不明，也没有入葬以外，成祖朱棣、仁宗朱高炽、宣宗朱瞻基都实行殉葬，不知有多少无辜的嫔妃和宫女成为这种残酷制度的牺牲品。直到英宗朱祁镇时，才下遗诏永远废止“人殉”。
朱由检此时以“殉葬”举例，自然是给矫情的大臣们出了一个难题。因为如果要守祖制，就应该实行殉葬；但废除殉葬实是深得人心之举，英宗之后再无人反对过，那岂不是从英宗开始，所有皇帝和大臣全都违反了祖制？如果废除殉葬不算违反祖制的话，那么废除同样残酷的宦官制度，为什么就算违反祖制呢？
礼部尚书来宗道见从“祖制”上压不住崇祯，便想从现实困难上入手。他干笑着奏道：“陛下宅心仁厚，禁止新进宦官，实乃旷世善举。然宫中有二十四监，各司其职，如果骤然停用所有内官，则不免产生混乱。以臣之见，不如暂行留用现有宦官，再徐徐而改之。”
朱由检却笑道：“这个不劳尚书大人忧心，朕已有安排了。”说着他就把早已写好的“二十四监”的改革方案发给群臣传阅。
原来这“二十四监”即是专门为皇室服务的机构，全由太监担任首领，统管宫中所有宦官与宫女。依其职能不同，又分为十二监、四司、八局，以司礼监为首，涵盖了宫中的大事小情。
而朱由检的改革方案也堪称大刀阔斧，第一条就是裁撤司礼监，收缴皇帝二十三宝，将至关重要的批红权重新收归皇帝手中。相应增设“秘书处”，协助皇帝批阅奏章，但没有任何实际权力。
第二条是裁撤御马监。因为御马监掌管天下兵马调度，实与五军都督府职能重复，无非是在官员的头上又多加一个婆婆，故而干脆直接撤销。
第三条是将尚宝监与印绶监合并，成立新机构“档案处”。因为尚宝监负责管理宝玺、敕符、将军印信，印绶监掌管古今通集库以及铁券、诰敕、贴黄、印信、图书、勘合、符验、信符等，有些职能较为接近，有些则本来该归六部有司管辖，因此予以合并。
第四条是撤销内官监，新设“供应处”和“财务处”。内官监也是个权力较大、油水极多之处，因为它负责宫廷的一切采办事宜，还掌管内帑银，也就是皇帝的私房钱。内官监既管钱又花钱，相当于既是财务又是出纳，不出问题才怪，因此朱由检将它一分为二，供应处只负责采办，财务处只负责管理内库。
第五条是将尚膳监和八局中的酒醋面局合并，改为“炊事处”，功能基本不变，还是负责紫禁城中的饮食供应。但砍掉了尚膳监直接采购的权力，把采购权统一归到供应处，炊事处只负责做饭。
第六条则是将神宫监、直殿监、宝钞司、混堂司、浣衣局合并，成立新机构“卫生处”。因为这几个部门或负责洒扫庭除，或管理草纸、澡堂、洗衣服，职能非常相近。
第七条是将其余各监、司、局全部合并，成立“内务处”，管理其他杂项事物。
这样一来，二十四监就变成了秘书处、档案处、供应处、财务处、炊事处、卫生处、内务处七大处，机构大为减少，职能也得到整合。大臣们本想从中挑挑毛病，结果还真就挑不出来。再说归根结底，这些事都不属于朝政，而是皇帝的私事，大臣们也没什么置喙的余地。
但是来宗道还不死心，又假作为难地道：“陛下虽然增删得当，但这些机构让何人掌管？”
朱由检却早有准备，侃侃而言道：“朕已经想好了。虽然没了太监，但宫中还有数千宫女，从中选拔一些女官就是了。在选好女官之前，暂由皇后总揽七处，德妃兼管炊事处、卫生处和内务处。”
“这…这如何使得？”来宗道大惊失色道，“后妃何等尊贵，只宜居于宫中，岂可管这种微末小事？”
朱由检却正色道：“俗话说得好：男主外，女主内。紫禁城就是朕的家，皇后和德妃就是这个家的女主人，襙持家务不是很正常么？尚书大人的夫人，难道就不管家事？”
恰好群臣都知道来宗道是个“妻管严”，家里大事小情全都是他夫人说了算。朱由检说者无心，群臣却是听者有意，皆认为朱由检是故意讥讽来宗道惧内，因此无不讪笑。
来宗道的一张老脸涨得通红，却还不肯罢休道：“但原来的尚膳监中厨师均为宦官，若全部出宫，陛下与各位娘娘今日的御膳都成问题呀。”
朱由检哈哈大笑道：“尚书大人放心好了。宫中御膳，朕早就吃腻了；在藩邸之时，皇后与德妃就经常下厨为朕做饭，朕觉得可口得很呐！有二位娘娘指导，还有这么多心灵手巧的宫女，朕难道还能吃了夹生饭？”
来宗道还想说御膳皆有定制，依制而行方显皇室威严；可又一想，皇帝连太监都不要了，还有什么祖制不能改变。自己今天发言太多，没准已经引起皇帝不满，还是明哲保身，少说为佳。因此也只得说了句“陛下圣明，臣再无疑议”，便赶紧归班。
朱由检见群臣再无反对者，心里总算一块石头落了地，看来自己“温水煮青蛙”的战术果然奏效，废除宦官制度、改革宫廷机构这么大的事，居然也没受到什么阻力。
处理完这件事，朝臣就该奏报国家大事了。兵部尚书王在晋忙出班奏道：“陛下前日让各地督抚讨论和议之事，现蓟辽总督阎鸣泰、辽东经略高第、辽东巡抚袁崇焕、辽东前锋总兵官祖大寿及东江镇总兵官毛文龙的奏章已经递到。他们几人的看法大相径庭，请陛下御览！”
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