侧妃包玉怜有了身孕，这可是秦王府的一件大事。为此朱由检免去了她的工作，让她专心在府中养胎。正好因为民团暂无合适的军官，武功高强的蕊儿不得不临时代管，府中杂务无人料理，包玉怜可以顶替她几天。
包玉怜还有些不情愿，因为天天给附近的百姓看病，已经培养出感情来了。但朱由检却告诉她，孕妇的抵抗力本来就差，现在又正值春夏之交，天气越来越温暖，各种病菌也进入了活跃期。万一让病人传染，那可就了不得了。
“病菌”这个概念，朱由检并没有和别人提起过，但却告诉了身为医生的包玉怜。
包玉怜还半信半疑地道：“王爷，这些东西您都是从哪里听来的？既然‘病菌’肉眼不能得见，您又怎么知道它们是致病原因？”
“总之你听为夫的没错！”朱由检也没词了，只好敷衍道，“等什么时候为夫买个显微镜，你一看就知道了！”
借着这个由头，朱由检又开始部署卫生工作。首先他开始修建几间宽敞的浴室，男女各二间，至少可以同时容纳几十人淋浴。
当然在这个时代，他不可能马上做出锅炉、冷热水管道和淋浴喷头来，只得因陋就简，用几十个悬在头顶的大木桶代替。烧水和加水的工作也只能人工完成，为此泾阳商帮又招募了十几名浴室工人。
浴室的建成还需要几天时间，可新的规定已经提前通知到了所有工人、学生、商帮伙计和团勇：不论是谁，每天工作学习完毕之后，必须进行淋浴，否则一律不准吃晚饭！
此规定一出，登时引发轩然大波。陕西地处内陆，水资源较为缺乏，当地的农民并没有经常洗澡的习惯，顶多是天气炎热之时，晚上在自家院子中用凉水擦擦身子。这样千百年下来，村民们早已习惯了浑身脏臭，不论男女老幼，人人皆是如此，倒也不觉得有多难受。
可朱由检此时骤然让大家在浴室淋浴，大家一想到几十个人光着屁股共处一室，都觉得有些难以接受。尤其是一些保守的妇女，更是坚决不允。
但朱由检这次却不像平时那样彬彬有礼了，而是直接告诉大伙儿：谁要是再反对，立即开除出泾阳商帮！
看在白花花的银子的份上，大家只好不情不愿地服从了这项规定。当然朱由检也算是顾及到了老百姓的感受，多费了不少紧缺的砖块，把每个淋浴位隔成了单独的小室。
老百姓们还没缓过劲来，朱由检的第二项重大卫生措施又出台了：第一严禁随地吐痰，必须吐入草纸之中；第二严禁随地大小便，即使是在自家的农田和茅厕里也不行！白天想要解手，必须到指定的若干新建厕所；夜间在自家解手时，则必须使用泾阳商帮提供的恭桶，白天再将便溺之物倒入指定地点。
这下老百姓的抵触情绪就更大了。不论男女老幼，此前皆是有痰便吐，吐到哪算哪，谁还随身备着草纸？又有俗语说粪是农家宝，“肥水不流外人田”，村民们只要是在田间劳动，大小便都是就地解决的。而且家家都有猪圈，真正养猪的极少，主要目的还是当厕所用。
有些老百姓实在想不通，干脆亲自找上门来，对朱由检牢骚满腹地道：“帮主，管天管地，管不了拉屎放屁！咱们泾阳商帮是为百姓做了不少好事，可也不能连这些芝麻粒大的事都管吧！”
朱由检却是十分耐心地劝解道：“乡亲们，第一有痰当然要吐出来，第二粪是农家肥，这些我也知道。可你们知不知道，很多疾病正是经由痰液与新鲜粪便传播的！你们不怕得天花、鼠疫、白喉、血吸虫病、伤寒、霍乱这些病么？”
众人吓得连连摇头，这些病可都是要人命的！
“我也不是不让大家施肥，只是要对粪便进行统一的处理。”朱由检娓娓道来，“在修建厕所的同时，我还会挖几个大化粪池。将粪便倒进去以后，再加入生石灰，满了以后就将化粪池用土掩埋。过上一两个月，再将粪便挖出来，这时候的粪便已经干燥无害，仍可以当作肥料使用。至于随地吐痰，更是陋习，希望大家一定要改！”
众人这才将信将疑地散去。朱由检却是深深地叹了口气，心想这千百年来养成的卫生习惯，可不是一朝一夕就能改得了的。而对待陈规陋习，光靠嘴上宣传劝说可远远不够，必须使用铁腕手段！
于是朱由检下令抽选了几十名工人，成立卫生纠察队，专门在各家各户和田间地头转悠。一旦发现随地吐痰和随地大小便的行为，立即进行严惩：第一次罚银五两，第二次开除！
朱由检之所以这么重视卫生问题，是因为他知道在历史上多次发生严重的瘟疫，其实就是大规模流行的传染病，造成百姓的大量死亡。
尤其是明末这段时间，瘟疫屡屡爆发，天花和鼠疫横行肆虐，疫区往往十室九空，军民亡者不计其数。这也是明朝灭亡的重要原因之一。
而传染病的流行，就和卫生习惯有非常大的关系。所以朱由检才花大力气改善卫生条件，甚至不惜得罪老百姓，也要把这项至关重要的事情安排好。
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